Browsing by Author "Silva, Andreia V."
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- CAMPANHA DE RASTREIO ACÚSTICO “PELAGO-2022” SÉRIE PNAB/DCF – PELAGO (Primavera)Publication . Amorim, Pedro; Carrera, Pablo; Feijó, Diana; Mendes, Hugo; Silva, Dina; Silva, Andreia V.; Moreno, Ana; Instituto Português do Mar e Atmosfera, I.P.A campanha PELAGO22 decorreu do dia 01 ao 31 de março de 2022, e foi subdividida em duas partes. A primeira, de 01 a 09 de março, foi realizada a bordo do Navio de Investigação Miguel Oliver e a segunda, de 12 a 31 de março, no Navio de Investigação Vizconde de Eza, num total de 24 dias de trabalho no mar. A necessidade de troca de navio, entre as duas partes, deveu-se ao significativo agravamento de falhas elétricas pontuais existentes no navio Miguel Oliver. Na campanha foram rastreadas cerca de 1120 milhas náuticas (71 radiais), cobrindo a plataforma continental de Portugal e a Baía de Cádis(em Espanha), tendo-se realizado 42 lances de pesca pelágica. Foram ainda realizadas 29 operações de pesca complementares com a embarcação de cerco “Deus Não Falta”. O objetivo da campanha PELAGO22 foi determinar a distribuição espacial da sardinha, biqueirão e cavala, e estimar a sua abundância e biomassa, assim como avaliar a estrutura da comunidade de peixes pelágicos, a distribuição e abundância de ovos e larvas, o censo de aves e mamíferos e a caracterização das condições ambientais na plataforma continental portuguesa e Baia de Cádis. A energia acústica de peixe do total da campanha PELAGO22 foi mais elevada do que em 2020 e 2021. A maioria dos cardumes ocorreram entre os 10 e 40 m de profundidade, uma distribuição mais costeira do que nas campanhas anteriores. Foram estimadas cerca de 809 mil toneladas de sardinha correspondendo a 18 907 milhões de indivíduos, o que representa um aumento de 94% na biomassa e de 73% na abundância, em relação ao ano anterior. O biqueirão aumentou 64% na biomassa e 11% na abundância, em relação a 2021, tendo sido estimadas 121 mil toneladas e cerca de 5 636 milhões de indivíduos. Por outro lado, as 11 mil toneladas (106 milhões de indivíduos) de cavala estimadas representam uma diminuição na biomassa de 37% (e de 34% na abundância), em relação à campanha homóloga do ano anterior. Outras espécies ocorreram com frequência relevante nos arrastos pelágicos: carapau (43 %), boga (19 %) e sarda (19%). A estrutura da comunidade pelágica evidenciou diferenças geográficas semelhantes aos anos anteriores.
- R TOOLBOX GUIDELINES FOR AGE READING ANALYSESPublication . Silva, Andreia V.; Soares, Eduardo; Instituto Português do Mar e da Atmosfera, I.P.Fish otolith age calibration and exchanges are carried out periodically to improve the quality of age data used in age-based stock assessments. These calibrations use online tools for age reading and the statistical analysis are frequently done on Eltink 2000 spreadsheet. With the replacement of this software and Eltink limitations, statistical evaluation was performed using R code. This change has shown clear advantages as the R script runs automatically and much faster with multiple age readers and of otolith samples, also allowing for easy incorporation of other exploratory data analyses.
- REPORT OF THE WORKSHOP ON MODELLING CATCH-PER-UNIT-EFFORT (WKCPUE)Publication . Coelho, Rui; Fernandes, Ana Cláudia; Mendes, Hugo; Moura, Teresa; Serra-Pereira, Bárbara; Silva, Andreia V.; Silva, Cristina; Azevedo, Manuela; Instituto Português do Mar e da Atmosfera, I.P.Standardized Catch-Per-Unit-Effort (CPUE), i.e., data from commercial fisheries that have been statistically modelled to remove fishery dependant effect, are often used in stock assessments as indicators of abundance and biomass. Here we report the outcomes of the workshop on modeling CPUEs that took place virtually on the 3-5 November 2020 and 6-7 January 2021 organized by IPMA and integrated in PNAB/DCF (National Program of Biological Sampling). We provide a summary of the methods used, focusing particularly on Generalized Linear Models (GLM) with Tweedie distributions for treatment of zero captures. We provide examples of case-studies developed and discussed, namely Norway lobster (Nephrops norvegicus) caught by crustacean trawlers, black-bellied anglerfish (Lophius budegassa) caught by the polyvalent fleet, chub mackerel (Scomber colias) discards and hake (Merluccius merluccius) caught by the Portuguese trawl fleet. The discussions on the exploration of input data and model fitting resulted in some recommendation for future work, summarized at the end of the report.