R TOOLBOX GUIDELINES FOR AGE READING ANALYSES

Silva, Andreia V.; Soares, Eduardo

http://hdl.handle.net/10400.26/59366

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33-R TOOLBOX GUIDELINES FOR AGE READING ANALYSES.pdf		1.89 MB	Adobe PDF	Download

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Authors

Silva, Andreia V.

Soares, Eduardo

Abstract(s)

Fish otolith age calibration and exchanges are carried out periodically to improve the quality of age data used in age-based stock assessments. These calibrations use online tools for age reading and the statistical analysis are frequently done on Eltink 2000 spreadsheet. With the replacement of this software and Eltink limitations, statistical evaluation was performed using R code. This change has shown clear advantages as the R script runs automatically and much faster with multiple age readers and of otolith samples, also allowing for easy incorporation of other exploratory data analyses.

As calibrações e intercâmbios entre instituições e para a atribuição de idades a partir de otólitos de peixes são realizados regularmente por forma a melhorar a qualidade dos dados de idades que são usados para a gestão de stocks de peixes. Nestas intercalibrações são usadas ferramentas online para a análise das leituras de idade e as análises estatísticas são geralmente realizadas na folha de cálculo Eltink 2000. Devido à substituição desta ferramenta, houve a necessidade de desenvolver as análises estatísticas em programação R. Esta alteração mostrou ter vantagens uma vez que funciona de forma automática e rápida com um elevado número de leitores e de amostras de otólitos, permitindo também incorporar facilmente novas análises exploratórias.