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Prevalência De Estirpes Multirresistentes De Escherichia Coli, Isoladas De Vitelos Com Diarreia Neonatal Oriundos Dos Departamentos Do Cantal, Haute-Loire, Loire E Puy-De-Dôme (França)

2024-07-08Master thesis Embargoed access
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dc.contributor.advisorDa Silveira, Maria Eduarda Moreno
dc.contributor.authorProvost, Clémence Marie Camillle
dc.date.accessioned2024-10-29T14:01:00Z
dc.date.embargo2027-07-08
dc.date.issued2024-07-08
dc.description.abstractEscherichia coli Enterotoxigénica (ETEC), apresenta uma elevada prevalência na Diarreia Neonatal Bovina (DNB). Esta é uma doença mul=fatorial afetando principalmente os vitelos nas primeiras semanas de vida, levando a elevadas perdas económicas. A par=r de dados clínicos cedidos pelos Laboratórios de TERANA, França, foi construída uma base de dados, que permi=u analisar o perfil de virulência e de susce=bilidade a an=microbianos, entre o período de 2016 a 2022 em 2367 isolados de E. coli provenientes de amostras fecais de vitelos suspeitos de serem portadores de DNB. A iden=ficação dos isolados foi realizada por API 20E e Maldi-ToF MS e a pesquisa de fatores de virulência (FV) fimbriais e não fimbriais por método de aglu=nação em lâmina. Este estudo pretendeu ainda verificar a possível relação entre a presença de FV e perfis de mul=rresistência (MDR) nos isolados em estudo. No total dos isolados observou-se que 59% (1388/2367) eram portadores de FV. CS31A foi o FV mais prevalente (61%), seguido de F5 (20%), F17 (8%), F41 e F6 (2%). Rela=vamente ao perfil de resistência a an=microbianos (AMR), observou-se uma elevada prevalência de isolados portadores de resistência a aminoglicosídeos e aminopenicilinas (89%); tetraciclinas (80%); quinolonas (48%) e sulfonamidas (42%). Em outras categorias destacou-se a resistência à cefuroxima (26%); flumequina (34%), florfenicol (27%) e à colis=na 1% (p<0.05). Verificou-se que 85% dos isolados (2010/2367) eram portadores de perfil de MDR, dos quais 61% (1233/2010) transportavam FV. Observou-se ainda que o perfil MDR mais prevalente incluía resistência simultânea a aminopenicilinas, aminoglicosídeos e tetraciclinas (43,34%), associado ao FV CS31A (47%), seguido de aminoglicosídeos, tetraciclinas e sulfonamidas em isolados não portadores de FV (43%) (p<0.05). Perante os resultados é possível concluir que bovinos portadores de DNB por ETEC podem cons=tuir um reservatório não só de E. coli portadora de FV mas também de perfil MDR associado ao FV não fimbrial CS31A, ou não associado a qualquer FV. O facto de poderem ocorrer eventos de transferência horizontal poderá contribuir para a disseminação de FV associados a perfil MDR para E. coli não patogénica (NPEC) endógena da microbiota intes=nal, quer dos animais, quer do Homem, cons=tuindo um risco de saúde pública e exigindo medidas de monitorização não só de es=rpes de ETEC mas de NPEC .pt_PT
dc.description.abstractEscherichia coli Enterotoxigenic (ETEC) presents a high prevalence in Neonatal Bovine Diarrhea (NBD). This is a mul=factorial disease primarily affec=ng calves in the first weeks of life, leading to significant economic losses. Using clinical data provided by TERANA Laboratories, France, a database was constructed to analyze the virulence profile and an=microbial suscep=bility between 2016 and 2022 in 2367 E. coli isolates from fecal samples of calves suspected of having NBD. The iden=fica=on of isolates was performed by API 20E and Maldi-ToF MS, and the search for fimbrial and non-fimbrial virulence factors (VF) was conducted using the slide agglu=na=on method. This study also aimed to verify the possible rela=onship between the presence of VF and mul=drug resistance (MDR) profiles in the studied isolates. Of the total isolates, 59% (1388/2367) were carriers of VF. CS31A was the most prevalent VF (61%), followed by F5 (20%), F17 (8%), F41, and F6 (2%). Regarding the an=microbial resistance (AMR) profile, a high prevalence of isolates carrying resistance to aminoglycosides and aminopenicillins (89%); tetracyclines (80%); quinolones (48%); and sulfonamides (42%) was observed. In other categories, resistance to cefuroxime (26%); flumequine (34%); florfenicol (27%); and colis=n (1%) was notable (p<0.05). It was found that 85% of the isolates (2010/2367) carried the MDR profile, of which 61% (1233/2010) carried FV. It was also observed that the most prevalent MDR profile included simultaneous resistance to aminopenicillins, aminoglycosides and tetracyclines (43.34%), associated with FV CS31A (47%), followed by aminoglycosides, tetracyclines and sulfonamides in isolates not carrying FV (43 %) (p<0.05). The results suggest that ca|le with NBD due to ETEC can serve as a reservoir not only of E. coli carrying VF but also of MDR profiles associated with the non-fimbrial VF CS31A or not associated with any VF. The possibility of horizontal gene transfer events could contribute to the dissemina=on of VF associated with MDR profiles to non-pathogenic E. coli (NPEC) endogenous to the intes=nal microbiota, both in animals and humans, posing a public health risk and necessita=ng monitoring measures for both ETEC and NPEC strains.pt_PT
dc.identifier.tid203713990pt_PT
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/10400.26/52653
dc.language.isoporpt_PT
dc.subjectAntimicrobianospt_PT
dc.subjectDiarreia Neonatal Bovinapt_PT
dc.subjectEscherichia Colipt_PT
dc.subjectFatores De Virulênciapt_PT
dc.subjectMultirresistênciapt_PT
dc.subjectAntimicrobialspt_PT
dc.subjectNeonatal Bovine Diarrheapt_PT
dc.subjectEscherichia Colipt_PT
dc.subjectVirulence Factorspt_PT
dc.subjectMultidrug Resistancept_PT
dc.titlePrevalência De Estirpes Multirresistentes De Escherichia Coli, Isoladas De Vitelos Com Diarreia Neonatal Oriundos Dos Departamentos Do Cantal, Haute-Loire, Loire E Puy-De-Dôme (França)pt_PT
dc.typemaster thesis
dspace.entity.typePublication
rcaap.rightsembargoedAccesspt_PT
rcaap.typemasterThesispt_PT
thesis.degree.nameMedicina Veterináriapt_PT

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